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　　古菌是生活在極端自然環(huán)境（如高溫、低溫、強酸、強堿、高壓、厭氧或高鹽）的一類特殊微生物。嗜鹽古菌是古菌域真古菌界中的一個重要類群，主要分布于各種高鹽環(huán)境，在醫(yī)藥和化工等方面具有應用前景。嗜鹽古菌質粒研究為更好地開發(fā)利用嗜鹽古菌資源和揭示高鹽環(huán)境基因水平轉移奠定基礎。 

　　中國科學院昆明植物研究所楊祝良研究員指導的博士生陳紹興等從29株嗜鹽古菌中分離到一新型質粒，命名為pHRDV1。在對該質粒進行了基因組測序的基礎上，開展了生物信息學預測分析和分子遺傳學特征鑒定研究。研究結果表明，該質粒的基因組大小為13053 bp，共有19個開放閱讀框，并組成了兩個頭對頭轉錄方向的操縱子結構；生物學軟件所預測出的雙復制區(qū)中的一個具有復制起始活性；不可思議的是，在其基因組上具有三個類似于嗜鹽古菌多形病毒特征性蛋白基因；依據(jù)該特征，該質?？蓺w為嗜鹽古菌多形病毒II型，但該質粒又具有該型病毒不具備的復制蛋白基因；此外，在質?；蚪M上，還具有類似于嗜鹽古菌溫和噬菌體的阻遏物-操作系統(tǒng)。質粒pHRDV1不僅具有普通質粒自主復制功能，還與嗜鹽古菌病毒存在某種尚未被解析的密切聯(lián)系。研究認為質粒pHRDV1代表了嗜鹽古菌質粒的一種新類型。該研究結果在微生物學領域主流期刊Extremophiles 上在線發(fā)表。（http://link.springer.com/content/pdf/10.1007%2Fs00792-013-0599-4.pdf）

　　圖1. 質粒pHRDV1的分離和核酸類型鑒定. 

　　圖2. 質粒pHRDV1基因組構成模式圖. 

圖3. 質粒pHRDV1基因組上19個預測基因的轉錄模式