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　　溫帶竹類包括具有重要經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價值的毛竹和熊貓主食竹種箭竹等，廣泛分布于亞洲、北美和非洲地區(qū)，但以我國屬種數(shù)目最為豐富。由于形態(tài)性狀復(fù)雜多變，開花周期長而難以獲得具花標(biāo)本，從而導(dǎo)致溫帶竹類物種界定困難，屬間關(guān)系爭議很大。 

　　中國科學(xué)院昆明植物研究所李德銖研究組多年致力于溫帶竹類的分類和系統(tǒng)發(fā)育研究，在大量材料收集的基礎(chǔ)上，基于8個葉綠體DNA片段的分析將溫帶竹類劃分為10個主要支系（Zeng, Zhang & al., 2010, Mol. Phylo. Evol）。最近基于葉綠體DNA和核DNA片段的分析，又發(fā)現(xiàn)了第11個支系（Yang, Zhang & al. 2013, Mol. Phylo. Evol），但這些主要支系內(nèi)部和它們之間的關(guān)系卻懸而未決。 

　　新一代測序技術(shù)的發(fā)展和系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)的興起為解決這些困難類群的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系帶來了契機(jī)。在前期研究的基礎(chǔ)上（Zhang, Ma & Li, 2011, PLOS ONE），該研究組馬朋飛博士等利用全葉綠體基因組序列對溫帶竹類11個主要支系的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系進(jìn)行了深入的分析，主要結(jié)論如下：1）葉綠基因組不同區(qū)域（大單拷貝區(qū)、小單拷貝區(qū)和重復(fù)序列區(qū)）以及編碼區(qū)和非編碼區(qū)序列所構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系高度一致，系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系在全葉綠體基因組序列的分析中得到了最大程度的解決；2）不同數(shù)據(jù)分割（data partitioning）的系統(tǒng)發(fā)育分析得到的結(jié)果十分相似，然而不同數(shù)據(jù)分割對于系統(tǒng)發(fā)育分析的適合度卻截然不同，在葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)分析中值得嘗試；3）溫帶竹類11個主要支系的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系得到了很好的解決，并且推斷所構(gòu)建的系統(tǒng)關(guān)系基本上不會受到不同分析方法、可能的系統(tǒng)誤差以及類群取樣多少的影響；4）與在較高分類階元植物系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系的構(gòu)建相比，葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)在較低分類階元的植物類群中同樣具有重要的應(yīng)用價值。 

　　該研究對于揭示溫帶竹類的起源與演化具有重要的科學(xué)意義，對進(jìn)一步研究該類群物種多樣性的形成和演化歷史打下了堅實的基礎(chǔ)，也為利用葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)解決其它困難植物類群的演化關(guān)系提供了一個典型案例。該研究得到了國家自然科學(xué)基金項目（U1136603, 31170204和30990244）和云南省創(chuàng)新團(tuán)隊項目的支持，已在線發(fā)表在國際演化生物學(xué)的頂尖期刊 Systematic Biology 上（http://sysbio.oxfordjournals.org/content/early/2014/08/04/sysbio.syu054.short?rss=1）。 

　　溫帶竹類11個主要支系之間的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系（學(xué)名后的羅馬數(shù)字為溫帶竹子主要支系的編號）