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中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所
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科研進(jìn)展

昆明植物所在竹類開(kāi)花相關(guān)miRNA研究中取得新進(jìn)展

文章來(lái)源:種質(zhì)資源庫(kù)  |  發(fā)布時(shí)間:2014-12-01  |  作者:王曉燕  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  miRNA(micoRNA)是一類長(zhǎng)度為18-24nt的非編碼內(nèi)源小分子RNA,在植物中,miRNA通過(guò)RISC復(fù)合體實(shí)現(xiàn)對(duì)靶基因mRNA的翻譯抑制或降解,從而對(duì)植物的生命活動(dòng)進(jìn)行調(diào)控。植物的生長(zhǎng)周期分為營(yíng)養(yǎng)生長(zhǎng)期和生殖生長(zhǎng)期兩個(gè)階段,兩個(gè)時(shí)期的轉(zhuǎn)化是植物整個(gè)生命周期中極為關(guān)鍵的一環(huán),miRNA在其中發(fā)揮著巨大且不可替代的作用。 

  竹類植物開(kāi)花一直是植物界的“難解之謎”。中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所郭振華研究組在對(duì)多年生零星開(kāi)花的熱帶木本竹種麻竹(Dendrocalamus latiflorus)的開(kāi)花習(xí)性進(jìn)行多年觀察的基礎(chǔ)上,對(duì)其開(kāi)花相關(guān)miRNA進(jìn)行了系統(tǒng)深入的研究。研究通過(guò)Solexa深度測(cè)序技術(shù)構(gòu)建了兩個(gè)不同發(fā)育階段的麻竹花的sRNA序列文庫(kù),并從中獲得了118個(gè)保守miRNA47個(gè)麻竹特有miRNA,在對(duì)這些miRNA的進(jìn)一步分析中,發(fā)現(xiàn)15個(gè)miRNA的功能是與花發(fā)育相關(guān)的。此外,我們也建立了麻竹花miRNA的靶基因數(shù)據(jù)庫(kù),并通過(guò)5’RACE獲取了部分靶基因的剪切位點(diǎn)。本研究首次對(duì)竹亞科植物中花的miRNA進(jìn)行了全面的分析,并對(duì)miRNA在竹子開(kāi)花現(xiàn)象中的調(diào)控作用進(jìn)行了初步探討,進(jìn)一步闡明了竹子開(kāi)花的內(nèi)在分子機(jī)制。 

  近日,該研究成果以“Investigating the MicroRNAomes of Two Developmental Phases of Dendrocalamus latiflorus (Poaceae: Bambusoideae) Inflorescences”為題發(fā)表于《植物分子生物學(xué)導(dǎo)報(bào)》(Plant Molecular Biology Reporter)上(http://link.springer.com/article/10.1007/s11105-014-0808-z),項(xiàng)目得到了國(guó)家自然科學(xué)基金和中國(guó)科學(xué)院“西部之光”人才培養(yǎng)計(jì)劃支持。

  圖1:a-d sRNA類型和數(shù)量在時(shí)期12中的分布總結(jié)。 

  a. Uniq-sRNAs的餅圖  b. Total-RNA的餅圖 

  c.在時(shí)期12uniqe sRNAs的分布(X軸表示RNA的分類,Y軸表示uniq-sRNA 的數(shù)量) 

  d.時(shí)期12total sRNAs的分布(X軸表示RNA的分類,Y軸表示total sRNA 的數(shù)量) 

  2:dla-miR396b前體在時(shí)期1中的比對(duì) 

 

 


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