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中國科學(xué)院昆明植物研究所
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喜馬拉雅-橫斷山區(qū)杜鵑屬植物DNA條形碼研究進(jìn)展

文章來源:  |  發(fā)布時(shí)間:2014-12-30  |  作者:嚴(yán)麗君  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  杜鵑屬(Rhododendron是中國種子植物最大的屬,在中國有590種左右(包括近年來發(fā)表的新種),占全球該屬植物的60%。喜馬拉雅-橫斷山區(qū)是杜鵑屬植物的起源和分化中心之一,分布有317種杜鵑花,其中210種為本地區(qū)特有種,占中國杜鵑屬物種數(shù)的55.5%。快速輻射物種形成和種間自然雜交導(dǎo)致杜鵑屬不同物種間形態(tài)界限模糊,物種的準(zhǔn)確鑒定非常困難,被認(rèn)為是最困難的分類類群之一。 

  最近,中國科學(xué)院昆明植物研究所高連明研究組和李德銖研究組合作,利用四個(gè)DNA條形碼片段(ITS、psbA-trnH、matK rbcL)對分布于喜馬拉雅-橫斷山區(qū)的173種(531個(gè)個(gè)體)杜鵑花進(jìn)行了 DNA 條形碼研究。研究結(jié)果表明,不同的分析方法(NJ, PWG BLAST)對物種的鑒別率有所不同,BLAST分析通常能得到最高的物種鑒別率,而基于系統(tǒng)發(fā)育鄰接樹(NJ)分析法得到的物種鑒別最低,使用不同分析方法得到的物種分辨率之間不易直接比較。基于 PWG 的鑒定結(jié)果,四個(gè)DNA條形碼對杜鵑屬物種鑒別率介于 12.21% - 25.19% 之間,鑒別成功率依次為 ITS < rbcL < matK < psbA-trnH。研究認(rèn)為 psbA-trnH 是杜鵑屬物種鑒定的最佳單個(gè)條碼片段,而核基因片段 ITS 鑒定率低的原因很可能是由于種間雜交和基因漸滲有關(guān)。研究人員根據(jù)不同條形碼組合的鑒定效率,提出了鑒別杜鵑屬植物的最佳條形碼組合為ITS + psbA-trnH + matK。研究人員還對影響喜馬拉雅-橫斷山區(qū)杜鵑屬物種鑒定率較低的因素進(jìn)行了深入討論,并提出將 DNA 條形碼結(jié)果與物種分布地和生境同時(shí)考慮,將有助于提高物種的鑒別率。研究人員認(rèn)為 DNA 條形碼技術(shù)雖然在杜鵑屬的物種鑒定率不高(約42%),但在亞屬和組水平上具有高鑒別率,其技術(shù)對生物多樣性熱點(diǎn)地區(qū)的物種鑒定和評價(jià)方面可提供重要信息。 

  該研究成果最近以DNA barcoding of Rhododendron (Ericaceae), the largest Chinese plant genus in biodiversity hotspots of the Himalaya–Hengduan Mountains為題發(fā)表于 Molecular Ecology Resource 上(http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.12353/abstract),該研究得到中國科學(xué)院大科學(xué)裝置(2009-LSFGBOWS-01)、中國科學(xué)院重點(diǎn)部署項(xiàng)目(KJZD-EW-L07, KSCX2-EW-Z-2, KSCX2-EW-Q-10)以及科技部基礎(chǔ)性工作專項(xiàng)(2012FY110800)的資助 

基于四個(gè)條形碼聯(lián)合片段構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育鄰接樹,顯示杜鵑屬植物亞屬和組水平上的鑒定率


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