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昆明植物所李德銖研究組在竹類植物葉綠體基因組中發(fā)現(xiàn)水平基因轉(zhuǎn)移

文章來源:  |  發(fā)布時(shí)間:2015-06-26  |  作者:馬朋飛  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  水平基因轉(zhuǎn)移(horizontal gene transferHGT)是指不同物種間,或是同一物種內(nèi)不同細(xì)胞器間或細(xì)胞器與細(xì)胞核之間遺傳物質(zhì)橫向傳遞的過程。目前已知的水平基因轉(zhuǎn)移主要發(fā)生在原核生物以及單細(xì)胞真核生物中,對這些類群生物的進(jìn)化起著十分重要的作用。近年來,越來越多的水平基因轉(zhuǎn)移現(xiàn)象在多細(xì)胞真核生物中被發(fā)現(xiàn),尤其是在被子植物不同細(xì)胞器之間,如線粒體(mitochondrion)基因組中常存在大量來自葉綠體(plastid)基因組的水平基因轉(zhuǎn)移。然而,被子植物葉綠體基因組在進(jìn)化上十分保守,極少發(fā)現(xiàn)水平基因轉(zhuǎn)移,目前僅在兩種真雙子葉植物中有報(bào)道。 

  中國科學(xué)院昆明植物研究所李德銖研究組長期致力于竹類植物系統(tǒng)發(fā)育研究。近來,該研究組馬朋飛博士等科研人員完成了草本竹類Pariana3種植物的葉綠體基因組測序,發(fā)現(xiàn)其在結(jié)構(gòu)組成、基因含量等特征上與已知的竹類葉綠體基因組十分相似。然而,在該葉綠體基因組的反向序列重復(fù)區(qū)發(fā)現(xiàn)一段大小為~2.7 kb的外源DNA片段,并且通過測序深度分析、PCR克隆擴(kuò)增等手段證實(shí)了拼接序列的可靠性。通過Blast比對分析發(fā)現(xiàn)這段外源插入序列與該組報(bào)道的鐵竹以及先前報(bào)道的綠竹線粒體基因組序列具有極高的相似性,推測其為線粒體DNA片段的水平轉(zhuǎn)移。這是第一例發(fā)現(xiàn)在單子葉葉綠體基因組中的水平基因轉(zhuǎn)移,進(jìn)一步證實(shí)了被子植物葉綠體基因組中水平基因轉(zhuǎn)移的存在。該研究對于探討葉綠體基因組中水平基因轉(zhuǎn)移的機(jī)制以及在被子植物進(jìn)化中所起的作用具有重要的意義。 

  該研究以“Evidence for horizontal transfer of mitochondrial DNA to the plastid genome in a bamboo genus”為題在線發(fā)表于國際期刊 Scientific Reports 上(http://www.nature.com/srep/2015/150623/srep11608/full/srep11608.html)。該研究得到了國家自然科學(xué)基金以及NSFC—云南省聯(lián)合基金項(xiàng)目(U1136603, 3117020431300184)的支持。 

竹類植物葉綠體基因組中水平轉(zhuǎn)移DNA片段的大小及位置

    


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