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　　澤瀉目（Alismatales）是單子葉植物分支（Monocots）中的一個非常重要的水生類群，并且可能是被子植物最早“下?！钡囊粋€祖?zhèn)飨担诘秃０稁鷳B(tài)系統(tǒng)中扮演著重要的角色。在當(dāng)前通行的APG系統(tǒng)中，澤瀉目是單子葉植物在其最基部的菖蒲目（Acorales）后隨即分化出來的基部類群。十余年來，基于DNA片段所做的分子系統(tǒng)學(xué)研究似乎支持天南星科（Araceae）為澤瀉目的基部類群，但仍存在諸多疑問。 

　　最近，中國科學(xué)院昆明植物研究所李德銖研究組和王紅研究組的博士生駱洋與馬朋飛博士等人合作，基于葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)探討了單子葉植物的早期演化。該團隊首次測定了巖菖蒲科（Tofieldiaceae）、眼子菜科（Potamogetonaceae）和澤瀉科（Alismataceae）幾個代表種的葉綠體全基因組，發(fā)現(xiàn)利川慈姑（Sagittaria lichuanensis）的葉綠體基因組總長為179,007bp，是目前在單子葉植物中發(fā)現(xiàn)的最大的葉綠體基因組，并在慈姑屬（Sagittaria）和眼子菜屬（Potamogeton）中分別發(fā)現(xiàn)了一個約2.4kb和6kb的倒位。選取79個葉綠體蛋白質(zhì)編碼基因，基于不同的數(shù)據(jù)分析方法重建了早期分化的單子葉植物分支的分子系統(tǒng)發(fā)育框架，明確了澤瀉目為單系，巖菖蒲科是澤瀉目最基部的類群。 

　　該研究對于揭示單子葉植物分支早期的起源和演化具有重要的科學(xué)意義，也為利用葉綠體系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)確定被子植物演化的關(guān)鍵節(jié)點提供了一個重要案例。該研究得到了國家重大科學(xué)研究計劃項目（2014CB954100）、國家自然科學(xué)基金委重大國際合作項目（31320103919）、國家自然科學(xué)基金面上項目（31270272）和中國科學(xué)院“青年創(chuàng)新促進會”人才專項（2015321）的支持。研究結(jié)果以“Plastid phylogenomic analyses resolve Tofieldiaceae as the root of the early diverging monocot order Alismatales”為題發(fā)表于基因組研究重要期刊 Genome Biology and Evolution（文章鏈接http://gbe.oxfordjournals.org/content/early/2016/03/08/gbe.evv260.short）。 

　　圖1 單子葉植物分支早期分化類群的葉綠體基因組結(jié)構(gòu)對比 

　　圖2 基于79個蛋白質(zhì)編碼基因的22個類群的系統(tǒng)發(fā)育樹