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　　杜鵑花泛指杜鵑花科 (Ericaceae) 杜鵑花屬 (Rhododendron L.) 植物。杜鵑花屬物種極其豐富，全世界杜鵑花屬植物超過 1000 種。杜鵑花屬植物因具有極高的觀賞和藥用價值而聞名，在世界各地得到廣泛栽培，已有幾百年的歷史。隨著測序技術(shù)的進(jìn)步，杜鵑花屬成員的基因組和轉(zhuǎn)錄組及其他多組學(xué)數(shù)據(jù)已經(jīng)被測序并由世界各地不同的實驗室相繼公布，為杜鵑的遺傳育種奠定了堅實的基礎(chǔ)。我國作為杜鵑花分布的中心之一，其中第一個測序發(fā)表的杜鵑基因組便是由云南省花卉所發(fā)布的馬纓杜鵑（R. delavayi）。隨著多組學(xué)數(shù)據(jù)的不斷增加，為了有效地存儲、整合和分析這些大規(guī)模的數(shù)據(jù)集，保證數(shù)據(jù)的一致性、獨立性和可維護(hù)性，亟待建立一個綜合性的整合分析平臺。

　　近日，由昆明植物研究所植物基因組演化與基因功能發(fā)掘團(tuán)隊章成君課題組構(gòu)建的一個杜鵑花屬數(shù)據(jù)庫RPGD（Rhododendron Plant Genome Database, http://bioinfor.kib.ac.cn/RPGD/)已經(jīng)發(fā)布。其整合了來自杜鵑花屬已測序發(fā)表的三個基因組數(shù)據(jù)，馬纓杜鵑、圓葉杜鵑（R. williamsianum）和映山紅（R. simsii）若干轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)和葉綠體基因組數(shù)據(jù)，并使用多種軟件流程對這些數(shù)據(jù)進(jìn)行詳盡的分析。得到了包括功能注釋，基因表達(dá)譜，基因家族，轉(zhuǎn)錄因子，同源基因，簡單序列重復(fù)等數(shù)據(jù)。該數(shù)據(jù)庫平臺基于LAMP框架和已分析得到的眾多數(shù)據(jù)，構(gòu)建了搜索引擎和許多實用的工具，包括 BLAST、JBrowse、同源基因、基因組共線性瀏覽器、兩側(cè)序列瀏覽器、表達(dá)量熱圖繪制、富集分析和批量下載等。這些工具將會為那些缺乏生物信息經(jīng)驗的課題組提供一個有效的分析手段。未來RPGD還會不斷的更新數(shù)據(jù)，并且發(fā)新的功能模塊，將為所有從事杜鵑花研究的人員提供了一個全面的、有極大幫助的平臺。相信 RPGD 將成為杜鵑花屬研究中不可或缺的重要工具。

　　 RPGD數(shù)據(jù)庫以題名The Rhododendron Plant Genome Database (RPGD): a comprehensive online omics database for Rhododendron發(fā)表在BMC Genomics上。上述研究成果，由國家自然科學(xué)基金（31760231）、國際花卉技術(shù)創(chuàng)新中心建設(shè)及成果產(chǎn)業(yè)化（2019ZG006）、科技領(lǐng)軍人才培養(yǎng)（2016HA005）、國家自然科學(xué)基金青年項目（32000180）等科研基金的資助。昆明植物所碩士研究生劉寧雅文為該論文的第一作者，云南省農(nóng)科院花卉所王繼華研究員與昆明植物研究所章成君研究員為共同通訊作者。

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Fig 1. Screenshots of online tools page 

Fig 2. Genome synteny viewer