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科研進展
昆明植物所基于天然產(chǎn)物研究提出并利用新型POSS策略發(fā)現(xiàn)潛在抗新冠病毒分子 文章來源:植物化學(xué)與西部植物資源持續(xù)利用國家重點實驗室 | 發(fā)布時間:2022-05-13 | 作者:周元飛 | 瀏覽次數(shù): | 【打印】 【關(guān)閉】 在天然產(chǎn)物化學(xué)研究中,通常由于無法獲得足量的新穎天然產(chǎn)物(Novel Natural Products, NNPs)而阻礙了深入的藥化及藥理學(xué)等研究的開展;天然產(chǎn)物(NPs)復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu)也導(dǎo)致其在全合成研究中存在極大挑戰(zhàn)。因此,化學(xué)家們開發(fā)了系列的合成策略,將NPs的結(jié)構(gòu)片段信息納入合成研究中,試圖以高效的方式發(fā)現(xiàn)潛在的活性分子。例如,Wender等的“Function-Oriented Synthesis(FOS)”策略是基于NPs的結(jié)構(gòu)和計算分析所得到的藥效團,并合成具有藥效團的簡化衍生物(圖 1a)。Waldmann等的“Biology-Oriented Synthesis(BIOS)”(圖 1a)策略則根據(jù)NPs的結(jié)構(gòu)特征設(shè)計和合成衍生物庫,從而提升所合成衍生物活性的可能性,并據(jù)此提出了“pesudo-Natural Products”的概念。以上策略主要運用于探索類天然骨架(Natural-like Scaffold)的化學(xué)空間。由于新穎天然骨架(Novel Natural Scaffold)攜帶著更為豐富的結(jié)構(gòu)信息,有必要進一步探索其潛在的應(yīng)用價值。 圖1 a) FOS和BIOS研究策略;b) 所提出的POSS策略并應(yīng)用于oridonin與maoelactone A 中國科學(xué)院昆明植物研究所等提出了挖掘新穎天然骨架潛在應(yīng)用價值的“Pharmacophore-Oriented Semisynthesis(POSS)”策略(圖 1b)。該策略的研究思路在于將天然骨架A的藥效團與新穎骨架B相結(jié)合,進一步通過結(jié)構(gòu)修飾與藥理學(xué)研究得到系列活性衍生物。根據(jù)該研究思路,開展了針對冬凌草甲素(oridonin,發(fā)現(xiàn)自冬凌草)與新穎二萜maoelactone A(發(fā)現(xiàn)自毛萼香茶菜)的原理證明實驗,即將oridonin的藥效團與maoelactone A的新穎骨架相結(jié)合從而得到新穎抗新冠病毒活性分子家族。 本研究中首次發(fā)現(xiàn)了具新穎5/5/6/6/5環(huán)系的對映-貝殼杉烷型化合物maoelactone A,并完成了10步仿生半合成研究(圖 2)。在化學(xué)合成中,首先利用C-15羥基的酸催化保護/脫保護方法成功實現(xiàn)了合成過程中最具挑戰(zhàn)性的C-2位羥化,其次發(fā)展了新穎的沃爾夫重排串聯(lián)內(nèi)酯化(Wolff rearrangement/lactonization cascade,WRLC)反應(yīng)用于一步構(gòu)建目標分子的5/5/6/6/5環(huán)系。理論計算表明WRLC反應(yīng)經(jīng)歷了協(xié)同的沃爾夫重排過程和水輔助的內(nèi)酯化過程。將該反應(yīng)應(yīng)用于POSS策略中,在高含量天然產(chǎn)物oridonin中成功實現(xiàn)了目標藥效團與5/5/6/6/5環(huán)系的組裝,并通過結(jié)構(gòu)修飾及抗新冠病毒活性篩選發(fā)現(xiàn)了系列新型活性分子。該類化合物能夠選擇性地抑制SARS-CoV-2 3CLPro酶活,并可能通過共價結(jié)合Cys145發(fā)揮抑制活力。所發(fā)現(xiàn)的活性化合物中,化合物70(圖 3)在新冠病毒感染的Vero E6細胞上顯示出極好的抑制活力與較高的選擇性指數(shù),其EC50值為19 nM,治療指數(shù)值大于1000,均優(yōu)于陽性對照藥瑞德西韋(remdesivir),顯示出了潛在的應(yīng)用前景。
圖2 Maoelactone A的仿生半合成
圖3化合物在Vero E6與HPA Epic細胞株中抑制新冠病毒復(fù)制的活力 該研究工作從發(fā)現(xiàn)maoelactone A起,歷時5年完成了結(jié)構(gòu)確證、仿生合成、結(jié)構(gòu)修飾及藥理活性的研究,是天然產(chǎn)物化學(xué)研究領(lǐng)域“發(fā)現(xiàn)分子—創(chuàng)造分子—利用分子”的一個成功案例。以上研究成果以Harnessing Natural Products by a Pharmacophore-Oriented Semisynthesis Approach for the Discovery of Potential Anti-SARS-CoV-2 Agents為題在線發(fā)表于國際著名期刊《德國應(yīng)用化學(xué)》(Angew. Chem. Int. Ed., 2022, e202201684)。 中國科學(xué)院昆明植物研究所周元飛博士、顏秉超博士、楊謙博士和中國科學(xué)院昆明動物研究所龍昕雁博士研究生為該論文的第一作者。中國科學(xué)院昆明植物研究所普諾·白瑪?shù)ぴ鲅芯繂T,中國科學(xué)院昆明動物研究所鄭永唐研究員,中國科學(xué)院上海有機所薛小松研究員為通訊作者。該研究工作得到了NSFC-云南聯(lián)合基金重點項目(U2002221),科技部第二次青藏高原綜合科學(xué)考察研究項目(2019QZKK0502),國家自然科學(xué)基金項目(81673329,81874298,22122104,21933004和82151214),中國科學(xué)院2019年度交叉團隊-重點實驗室合作研究專項和云南省杰青項目等項目的聯(lián)合資助。 (責(zé)任編輯:李雪)
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