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　　東南亞地區(qū)是全球生物多樣性熱點地區(qū)之一，生物多樣性高度富集。該地區(qū)還分布有世界上最大的島嶼群，是生物地理學早期發(fā)祥地，被譽為生物地理學研究的“天然實驗室”。地質(zhì)學證據(jù)表明東南亞地區(qū)具有復雜的地質(zhì)和氣候歷史，分別在距今4500萬年前、2500萬年前和500萬年前經(jīng)歷過三次劇烈的地質(zhì)事件。這些事件對該地區(qū)生物多樣性的起源演化產(chǎn)生了重要影響，但與地質(zhì)歷史相伴相生的過程中，生物類群的演化能否能反演該地區(qū)地質(zhì)和氣候歷史還不得而知。 

　　近日，中國科學院昆明植物研究所李德銖團隊依托中國西南野生生物種質(zhì)資源庫，通過與英國皇家植物園邱園、愛丁堡大學，加拿大多倫多大學、文萊大學和荷蘭萊頓大學等單位合作，選擇東南亞地區(qū)蕁麻科特有植物類群紫麻屬（Oreocnide）為研究對象，通過物種和地理分布區(qū)的全面取樣，利用基因組淺層測序獲得該屬10種共63個個體的質(zhì)體基因組和核糖體大亞基（nrDNA）序列，并據(jù)此重建了紫麻屬的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系；進而結(jié)合分子鐘估算和生態(tài)位模擬，深入開展了該屬植物的生物地理學研究。結(jié)果表明：（1）系統(tǒng)發(fā)育基因組學分析在很大程度上理清了紫麻屬內(nèi)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系，支持該屬為單系類群，并且發(fā)現(xiàn)屬內(nèi)除了三脈紫麻、廣西紫麻和寬葉紫麻外，其余種均為單系，暗示可能存在隱存種。（2）紫麻屬植物在距今約4200萬年前和其近緣類群分異，并在距今約606萬年前開始發(fā)生多樣化。結(jié)合該屬現(xiàn)生植物高溫、高濕的生境，推斷紫麻屬植物的多樣化可能和東南亞地區(qū)劇烈的地質(zhì)氣候事件息息相關(guān)，故推斷東南亞地區(qū)最后一次劇烈的地質(zhì)事件有可能發(fā)生在距今606萬年前，比地質(zhì)學證據(jù)早約100萬年。（3）紫麻屬植物起源于中國南方地區(qū)，先后經(jīng)過至少4次“大陸到島嶼”的長距離擴散事件形成現(xiàn)今分布格局，這暗示東南亞地區(qū)植物區(qū)系有很多遷入成分。（4）紫麻屬植物在距今313萬年前和119萬年前發(fā)生了快速物種形成。結(jié)合生態(tài)位模擬結(jié)果，推斷這可能映射了更新世以來該地區(qū)冰期震蕩和海陸變遷的歷史。綜上所述，該研究為認識東南亞地區(qū)生物、地史和氣候的協(xié)同演變提供了新的視角。 

　　該研究成果以Phylogenomics and evolutionary history of Oreocnide (Urticaceae) shed light on recent geological and climatic events in SE Asia為題在線發(fā)表于國際進化生物學主流期刊《分子系統(tǒng)發(fā)育和進化》（Molecular Phylogenetics and Evolution）。中國科學院昆明植物研究所吳增源副研究員為論文第一作者，李德銖研究員為通訊作者。本研究得到了中國科學院B類先導專項（XDB31000000）、國家自然科學基金項目（31970356, 41571059, 41971071）、中國科學院青年創(chuàng)新促進會（2019385）等項目的資助。 

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圖1 用不同方法估算紫麻屬的分化時間  

圖2 紫麻屬的生物地理歷史重建  

圖3 紫麻屬潛在分布區(qū)的變化