国产男女激情一区二区_亚洲无码免费视频网站_亚洲av无码之国产精品_久久精品国产自在天天线

中國科學(xué)院昆明植物研究所
location
當(dāng)前位置:首頁 > 新聞動(dòng)態(tài) > 科研進(jìn)展
left
新聞動(dòng)態(tài)
科研進(jìn)展

昆明植物所發(fā)現(xiàn)擬南芥AGL16與SOC1合作調(diào)控基因組水平基因表達(dá)和開花時(shí)間

文章來源:中國科學(xué)院東亞植物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,中國西南野生生物種質(zhì)資源庫  |  發(fā)布時(shí)間:2023-02-03  |  作者:董雪,郭振華,胡金勇  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  開花轉(zhuǎn)型時(shí)間決定了植物適合度并受一個(gè)復(fù)雜基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)調(diào)控,該網(wǎng)絡(luò)整合了內(nèi)在遺傳和外在環(huán)境因素的響應(yīng),如AGL16MADS-box轉(zhuǎn)錄因子在開花時(shí)間調(diào)控過程中起到了重要作用(Hu et al. 2014);但AGL16在基因組水平上如何影響下游基因及其表達(dá)仍未知。

  最近,中國科學(xué)院昆明植物研究所胡金勇團(tuán)隊(duì)與郭振華團(tuán)隊(duì)合作,基于染色質(zhì)免疫共沉淀聯(lián)合高通量測序和一系列遺傳學(xué)和生化與分子實(shí)驗(yàn),AGL16下游基因譜進(jìn)行了系統(tǒng)識(shí)別。研究發(fā)現(xiàn),AGL16能廣泛結(jié)合到超過2000多個(gè)基因的潛在啟動(dòng)子區(qū)域的CArG-box上;在已知約400個(gè)開花基因清單中,AGL16能結(jié)合到近70個(gè)在不同開花路徑中起調(diào)控作用的基因上,意味著AGL16調(diào)控開花時(shí)間的遺傳結(jié)果可能為不同路徑的凈效應(yīng)。進(jìn)一步分析表明AGL16可結(jié)合到關(guān)鍵開花促進(jìn)基因SOC1啟動(dòng)子的多個(gè)區(qū)域,并抑制其表達(dá);同時(shí),AGL16SOC1形成異源蛋白復(fù)合物并分享一系列共同靶標(biāo)基因,二者部分相互依賴負(fù)調(diào)控了基因組水平的基因表達(dá);遺傳學(xué)分析表明,AGL16功能缺失在SOC1功能突變背景下使擬南芥開花更加提前。研究不僅揭示了AGL16-SOC1復(fù)合體的復(fù)雜互作和調(diào)控模式,也為進(jìn)一步解析開花時(shí)間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。 

  近日,研究以AGL16 regulates genome-wide expression and flowering time with partial dependency on SOC1 in Arabidopsis為題,在線發(fā)表于Plant Physiology上。中國科學(xué)院昆明植物研究所董雪博士開展了全部生物信息學(xué)分析和部分遺傳學(xué)實(shí)驗(yàn),為文章第一作者。張利平博士開展了大部分染色質(zhì)免疫共沉淀實(shí)驗(yàn)和部分生化實(shí)驗(yàn),湯銀華和于冬梅博士開展了部分蛋白互作實(shí)驗(yàn),其他作者參與了樣品收集和部分?jǐn)?shù)據(jù)分析等工作。胡金勇和郭振華研究員為共同通訊作者。研究得到了國家自然科學(xué)基金3157031131501034、3170027531800261和中國科學(xué)院先導(dǎo)BXDB31000000)等支持,還部分得到了中國西南野生生物種質(zhì)資源庫和中國科學(xué)院東亞植物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室植物多維成像及多樣性分析等平臺(tái)的幫助。 

  文章鏈接

 

1. AGL16可結(jié)合到近70個(gè)開花基因的啟動(dòng)子區(qū)間 

 

2. AGL16SOC1形成異源蛋白復(fù)合體 

 

  3. AGL16-SOC1共享靶標(biāo)基因 

(責(zé)任編輯:李雪)

中國科學(xué)院昆明植物研究所

版權(quán)所有 Copyright © 2002-2025 中國科學(xué)院昆明植物研究所,All Rights Reserved 【滇ICP備05000394號(hào)
地址:中國云南省昆明市藍(lán)黑路132號(hào)  郵政編碼:650201    點(diǎn)擊這里聯(lián)系我們