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昆明植物所在異型花柱植物交配系統(tǒng)演變研究中取得重要進(jìn)展

文章來源:中國(guó)科學(xué)院東亞生物多樣性和生物地理學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室、中國(guó)西南野生生物種質(zhì)資源庫(kù)  |  發(fā)布時(shí)間:2020-08-10  |  作者:王昕嘉,周偉  |  瀏覽次數(shù):  |  【打印】 【關(guān)閉

 

  異交向自交的轉(zhuǎn)變通常被認(rèn)為是被子植物交配系統(tǒng)演變的整體趨勢(shì)。在被子植物中,約有10-15%的物種呈高度自交,已有的研究證據(jù)表明這些星散分布的自交物種多數(shù)是從其異交的祖先類群中經(jīng)過多次獨(dú)立分化而來。為何自交譜系和自交物種在近交衰退與遺傳負(fù)荷上升、遺傳多樣性與進(jìn)化適應(yīng)力下降等不利因素的影響下依然能從諸多異交類群中脫穎而出,但為何在較長(zhǎng)的進(jìn)化時(shí)間尺度上,自交譜系和自交物種又呈現(xiàn)出相對(duì)一致的進(jìn)化盲端(Dead end)現(xiàn)象?早在上個(gè)世紀(jì)中葉,這些問題已成為繁殖進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域關(guān)注的焦點(diǎn),至今卻仍有諸多核心的問題懸而未解。近年來,DNA測(cè)序技術(shù)的迅猛發(fā)展為探究被子植物交配系統(tǒng)演變的分子進(jìn)化機(jī)制提供了全新的技術(shù)框架和解決思路。 

  中國(guó)科學(xué)院昆明植物研究所植物多樣性與基因組學(xué)大團(tuán)隊(duì)李德銖研究組和植物多樣性演化和生態(tài)適應(yīng)大團(tuán)隊(duì)王紅研究組多年來關(guān)注異型花柱植物種群生態(tài)學(xué)和進(jìn)化遺傳學(xué)研究,逐步發(fā)展了具異型花柱的滇丁香屬(Luculia)、報(bào)春花屬(Primula)等日趨成熟的研究模式,該團(tuán)隊(duì)周偉副研究員等針對(duì)交配系統(tǒng)演化及其生態(tài)和遺傳效應(yīng)等熱點(diǎn)問題持續(xù)開展了精細(xì)的研究,取得了一系列重要的研究成果,包括異型花柱物種單態(tài)種群的起源(Zhou et al., 2012;Molecular Ecology)、異型花柱物種多態(tài)性結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性機(jī)制(Zhou et al., 2015; New Phytologist)、異型花柱植物自交譜系的發(fā)生途徑(Zhou et al., 2017; New Phytologist)和異型花柱類群自交譜系的獨(dú)立起源過程(Zhong et al., 2019;New Phytologist)等。 

  最近,該研究團(tuán)隊(duì)選取報(bào)春花屬為研究對(duì)象,借助該類群內(nèi)單基因突變(柱頭高度決定基因CYP734A50)誘發(fā)同型花柱發(fā)生的特殊機(jī)制,充分利用同型花柱起源與交配系統(tǒng)轉(zhuǎn)變同步發(fā)生的特性,針對(duì)不同轉(zhuǎn)變時(shí)間尺度下的組學(xué)數(shù)據(jù),種間選擇60個(gè)葉綠體基因組和12個(gè)轉(zhuǎn)錄組,種內(nèi)使用12個(gè)葉綠體基因組和13個(gè)轉(zhuǎn)錄組,采用PAML替代速率分析、MK檢驗(yàn)和DFE-α選擇強(qiáng)度與適應(yīng)性進(jìn)化分析,深入解析了交配系統(tǒng)由異交向自交轉(zhuǎn)變的遺傳和分子進(jìn)化效應(yīng)。研究表明,在異型花柱類群中伴隨著同型花柱的出現(xiàn)和自交的發(fā)生,近期衍生的自交物種呈現(xiàn)明顯的基因組自交綜合征(Genomic selfing syndrome):蛋白編碼區(qū)內(nèi)核苷酸遺傳多樣性及雜合度顯著降低;種間分異(dN/dS)及種下多態(tài)(πN/πS)位點(diǎn)上均呈現(xiàn)更高的非同義/同義替代速率,暗示自交物種在近中性突變位點(diǎn)(0 < Nes < 1)上受到相對(duì)低效的負(fù)選擇作用;而極度有害突變(Nes > 100)比例下降則預(yù)示清除效應(yīng)在自交物種中更為明顯;自交物種的適應(yīng)性進(jìn)化速率(ωα)呈現(xiàn)下降趨勢(shì)。 

  該研究首次在不同進(jìn)化時(shí)間尺度上檢測(cè)到異型花柱植物類群的基因組自交綜合征發(fā)育信號(hào)。更加有趣的是,這些遺傳綜合征的結(jié)果同樣存在于相對(duì)近期分化的中甸燈臺(tái)報(bào)春(Primula chungensis)自交譜系分支,而該物種的自交譜系甚至還沒有發(fā)育出表型自交綜合征。該研究首次發(fā)現(xiàn)交配系統(tǒng)轉(zhuǎn)變過程中遺傳與表型綜合征的理論建成順序,這些重要發(fā)現(xiàn)為植物交配系統(tǒng)轉(zhuǎn)變?cè)诨蚪M水平上的遺傳和分子進(jìn)化效應(yīng)提供了充分且詳實(shí)的證據(jù)。  

  研究成果以“The Genomic Selfing Syndrome Accompanies the Evolutionary Breakdown of Heterostyly”為題在國(guó)際分子進(jìn)化生物學(xué)領(lǐng)域頂級(jí)期刊Molecular Biology and Evolution在線發(fā)表。博士研究生王昕嘉為論文第一作者,王紅研究員和周偉副研究員為共同通訊作者。該研究得到中國(guó)科學(xué)院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)(XDB31000000)、國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31971394,3177041731570384)、云南省云嶺學(xué)者項(xiàng)目(YLXL20170001)和中國(guó)科學(xué)院西部之光”A類等的資助。 

  文章鏈接  

1 報(bào)春花屬(Primula)二型花柱與同型花柱物種交配系統(tǒng)轉(zhuǎn)變的分子進(jìn)化分析模型及相關(guān)研究結(jié)果。 

(責(zé)任編輯:李雪)

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