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昆明植物所在種子可漂浮蘇鐵的演化歷史研究中取得新進展 文章來源:資源植物與生物技術(shù)重點實驗室 | 發(fā)布時間:2021-08-05 | 作者:劉健 | 瀏覽次數(shù): | 【打印】 【關(guān)閉】 擴散如何影響植物的現(xiàn)代分布格局一直是進化生物學(xué)和生物地理學(xué)領(lǐng)域的熱點科學(xué)問題。由擴散能力較強的媒介(如鳥類,風(fēng)、洋流)介導(dǎo)的長距離擴散也被認為是島嶼植物區(qū)系演化、以及很多近緣植物類群間斷分布形成的主要驅(qū)動因素。洋流作為自然界中最大規(guī)模的水體運動,不僅可以促進不同緯度間的熱量輸送和交換,調(diào)節(jié)全球的熱量平衡,同時在海洋動物和具漂浮傳播體的植物擴散傳播中扮演著重要角色。然而,迄今為止極少有研究基于洋流循環(huán)模擬來解釋洋流如何影響濱海植物的演化歷史。 蘇鐵屬(Cycas)拳葉蘇鐵組(Section Cycas)刺葉蘇鐵亞組(Subsection Rumphiae)的部分物種(約10種)的種子具有類似海綿層的結(jié)構(gòu),且種子內(nèi)部空間較大,是典型的傳播體可以漂浮的植物類群(圖1)。這些物種都具有濱海生活習(xí)性,且間斷的分布于亞洲大陸、馬來群島及非洲的沿海地區(qū),是探究洋流循環(huán)如何影響植物演化歷史的理想類群。為了揭示這些群體的譜系地理結(jié)構(gòu)及其形成原因,研究人員對該類群不同分布區(qū)的個體進行取樣,基于葉綠體基因組數(shù)據(jù),重建了其系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系和譜系地理歷史?;诘乇硌罅餮h(huán)模型,通過模擬不同時期的蘇鐵傳播體在全局和多個區(qū)域的洋流漂流軌跡,探討了洋流對該類群譜系結(jié)構(gòu)及分布格局的影響。 結(jié)果表明,(1)種子可漂浮的蘇鐵類群聚為三個近期分化的分支(即印度洋,太平洋和巽他三個支系),呈現(xiàn)出明顯的譜系地理結(jié)構(gòu)(圖1),且地理距離和遺傳距離之間具有顯著的相關(guān)性,暗示了洋流介導(dǎo)的種子長距離傳播塑造了其遺傳結(jié)構(gòu)。(2)與種子不可漂浮的蘇鐵相比,種子可漂浮類群在分支內(nèi)部顯示了較為保守的核苷酸替換速率(圖2a),但這兩類類群之間沒有檢測到顯著的選擇壓差異(圖2b)。巽他分支的類群具有最低的核苷酸多樣性,暗示著巽他大陸內(nèi)部周期性路橋的出現(xiàn)促進了該區(qū)域頻繁的種間基因交流。受地理隔離的影響、并且分布在太平洋和印度洋的兩個分支受到了相對更強的純化選擇(圖2c),暗示了這兩個分支在隨洋流拓殖分布地過程中,通過清除有害突變來適應(yīng)新的生境。(3)洋流軌跡模擬結(jié)果顯示,漂流后登陸的區(qū)域范圍與現(xiàn)在的分布范圍十分吻合(圖1和圖3a),且不同譜系的漂流軌跡都限制在各自區(qū)域(圖3b-d)。這種一致性也從機制上印證了洋流循環(huán)不僅影響了該類群的濱海分布模式,而且在塑造該類群的譜系結(jié)構(gòu)中發(fā)揮了重要作用。另外,在地理交界區(qū)域的Palau和Flores這兩個島嶼之間存在一定程度的種子漂流軌跡交匯,這也正好解釋了系統(tǒng)發(fā)育分支所揭示的Palau和Flores分布的類群所具有的獨立的系統(tǒng)位置。 這些結(jié)果為研究濱海生態(tài)系統(tǒng)的演化歷史提供了新的視角,即結(jié)合多種證據(jù)驗證類群的長距離傳播假說;并利用洋流機制模擬的手段,解釋當今濱海分布類群譜系地理結(jié)構(gòu)的成因;以及通過系統(tǒng)發(fā)育基因組學(xué)和譜系地理學(xué)的方法來探討類群近期的演化歷史等問題。相關(guān)結(jié)果以“Congruence between ocean-dispersal modelling and phylogeography explains recent evolutionary history of Cycas species with buoyant seeds”為題近日發(fā)表在植物學(xué)主流期刊New Phytologist上。 該研究由中國科學(xué)院昆明植物研究所物種瀕危機制與保護遺傳學(xué)龔洵研究組主導(dǎo)完成,昆明植物研究所劉健博士為該論文的第一作者,泰國Nong Nooch熱帶植物園的Anders Lindstrom、北京大學(xué)陳永生博士和以色列耶路撒冷希伯來大學(xué)的Ran Nathan教授共同參與了該項研究。該研究得到中科院西部之光項目(Y8246811W1),國家自然科學(xué)基金(31900184, 31800191 和 32000169),云南省自然科學(xué)基金(202001AT070072)以及國家生態(tài)環(huán)境部生物多樣性調(diào)查與評估項目(2019HJ2096001006)等的支持。
圖1 種子可漂浮的蘇鐵類群的譜系地理樣式。不同分支的個體用不同顏色表示,分支II-IV為種子可漂浮的類群。陰影部分為該類群的主要分布區(qū)。箭頭代表主要的洋流及方向。插入的條形圖代表不同區(qū)域的核苷酸多樣性水平。左上角插圖顯示了蘇鐵屬的沿海生境,漂浮種子及其縱切圖。
圖2 基于葉綠體基因組蛋白編碼基因推算的(a)蘇鐵屬內(nèi)部的核苷酸替換速率;(b-c)在不同分支(類群)之間的非同義(dn)/同義核苷酸替換速率(ds)
圖3 種子可漂浮的蘇鐵類群在印度太平洋地區(qū)進行洋流模擬結(jié)果,灰色線條為模擬的軌跡,藍色點為尚在海洋漂流的個體,橙色點為在陸地或海島登陸的個體。 (責任編輯:李雪)
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