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　　開花轉(zhuǎn)型時間決定了植物適合度并受一個復(fù)雜基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)調(diào)控，該網(wǎng)絡(luò)整合了內(nèi)在遺傳和外在環(huán)境因素的響應(yīng)，如AGL16等MADS-box轉(zhuǎn)錄因子在開花時間調(diào)控過程中起到了重要作用（Hu et al. 2014）；但AGL16在基因組水平上如何影響下游基因及其表達(dá)仍未知。

　　最近，中國科學(xué)院昆明植物研究所胡金勇團(tuán)隊與郭振華團(tuán)隊合作，基于染色質(zhì)免疫共沉淀聯(lián)合高通量測序和一系列遺傳學(xué)和生化與分子實驗，對AGL16下游基因譜進(jìn)行了系統(tǒng)識別。研究發(fā)現(xiàn)，AGL16能廣泛結(jié)合到超過2000多個基因的潛在啟動子區(qū)域的CArG-box上；在已知約400個開花基因清單中，AGL16能結(jié)合到近70個在不同開花路徑中起調(diào)控作用的基因上，意味著AGL16調(diào)控開花時間的遺傳結(jié)果可能為不同路徑的凈效應(yīng)。進(jìn)一步分析表明AGL16可結(jié)合到關(guān)鍵開花促進(jìn)基因SOC1啟動子的多個區(qū)域，并抑制其表達(dá)；同時，AGL16與SOC1形成異源蛋白復(fù)合物并分享一系列共同靶標(biāo)基因，二者部分相互依賴負(fù)調(diào)控了基因組水平的基因表達(dá)；遺傳學(xué)分析表明，AGL16功能缺失在SOC1功能突變背景下使擬南芥開花更加提前。研究不僅揭示了AGL16-SOC1復(fù)合體的復(fù)雜互作和調(diào)控模式，也為進(jìn)一步解析開花時間調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的復(fù)雜機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。 

　　近日，研究以AGL16 regulates genome-wide expression and flowering time with partial dependency on SOC1 in Arabidopsis為題，在線發(fā)表于Plant Physiology上。中國科學(xué)院昆明植物研究所董雪博士開展了全部生物信息學(xué)分析和部分遺傳學(xué)實驗，為文章第一作者。張利平博士開展了大部分染色質(zhì)免疫共沉淀實驗和部分生化實驗，湯銀華和于冬梅博士開展了部分蛋白互作實驗，其他作者參與了樣品收集和部分?jǐn)?shù)據(jù)分析等工作。胡金勇和郭振華研究員為共同通訊作者。研究得到了國家自然科學(xué)基金（31570311、31501034、31700275、31800261）和中國科學(xué)院先導(dǎo)B（XDB31000000）等支持，還部分得到了中國西南野生生物種質(zhì)資源庫和中國科學(xué)院東亞植物多樣性與生物地理學(xué)重點(diǎn)實驗室植物多維成像及多樣性分析等平臺的幫助。 

　　文章鏈接

圖1. AGL16可結(jié)合到近70個開花基因的啟動子區(qū)間 

圖2. AGL16與SOC1形成異源蛋白復(fù)合體 

　　圖3. AGL16-SOC1共享靶標(biāo)基因